يأتي مصطلح " جرثومة" من الجذور اللاتينية تحديدًا من كلمة "جرثومة" أو "جرمينيس" والتي تعني "نسل" "جرثومة" أو "جذع" ، وتتألف من جذر "جين" الذي يعني الولادة أو الحمل واللاحقة "الرجال" كأداة. تعرّف الأكاديمية الملكية هذا المصطلح على أنه الفكرة التي تبدأ عملية تطوير حياة جديدة ، أي أنها مجموعة الخلايا التي تطور معًا كائنًا جديدًا. في الطب ، تعرف الكائنات الحية الدقيقة باسم جرثومة ، والتي تتكون من خلية ، وهي سبب الأمراض؛ يمكن أن يطلق على هذه الجرثومة جرثومة ممرضة ، إذا كانت واضحة ، وتنقسم إلى فئات مختلفة مثل: الفيروس الذي يسبب العدوى ، والذي يجب أن يتكاثر فقط في الخلايا المضيفة ؛ البكتيريا ، وهي كائن وحيد الخلية ، لا يمكن رؤيتها إلا من خلال المجهر ؛ ثم البروتوزوا ، وهي على شكل بيض ويرقات ، وهي مرحلة أو عملية التحول التي تعاني منها بعض الفقاريات.
في علم النبات ، تشير كلمة جرثومة إلى جزء من النبات يسمى الجذع ، وهو أول جزء ينبت من بذرة أو جنين يُطلق عليه هذا المصطلح أيضًا بالاسم. ومن الأمثلة الواضحة على ذلك جنين القمح ، وهو البذرة التي تولد من النبتة الجديدة ، وهي نوع من الأطعمة التي تعود على الجسم ببعض الفوائد ، حيث توفر فيتامين إي ، وتجدد الأنسجة ، حيث يحتوي على نسبة عالية من البروتينات والكربوهيدرات ، ويفيد في توفير عضلات جيدة ، وكذلك جدران الأوعية الدموية والقلب. أخيرًا ، في الفيزياء ، تسمى الجرثومة بلورة يتم إدخالها عندما يكون السائل في حالة تشبع فائق ، مما ينتج عنه تبلور.