يمكن تعريف الكائنات الحية الدقيقة على أنها نوع من الكائنات الحية ذات الحجم الصغير لدرجة أنها غير مرئية للعين البشرية. هذه يمكن أن تكون من أنواع مختلفة، من بين أهم يمكننا تسليط الضوء على الطحالب ، الفطريات والبكتيريا، الخ هناك من يحافظ على الفرضية القائلة بأن بعض الكائنات الحية الدقيقة كانت مقدمة للحياة على كوكب الأرض ، بينما تؤكد افتراضات أخرى أكثر تعقيدًا إلى حد ما أن هذه الكائنات من خارج كوكب الأرض وأنها في الوقت الذي توسعت فيه على وجه الكوكب الحياة لكل ما هو اليوم. بشكل عام ، من الشائع جدًا أن الكائنات الحية الدقيقة تتكون من خلية فريد ، ولكن هذا لا يعني أنه لا توجد تلك التي تتكون من أكثر من خلية واحدة.
بدافع الحاجة إلى مواجهة الأمراض ، كان لدراسة الكائنات الحية الدقيقة دافع كبير ، ولهذا السبب تطور الطب بنفس الطريقة التي تطورت بها المعرفة المتعلقة بهذه الكائنات الحية.
تعتبر بعض الكائنات الحية الدقيقة مسؤولة عن الإضرار ببعض الأطعمة ، والتي يمكن أن تكون ضارة لأولئك الأفراد الذين تناولوا مثل هذه الأطعمة ، مما تسبب في أمراض مختلفة ، على الرغم من وجود بعض الكائنات الحية الدقيقة التي يمكن أن تسهم في إجراءات مختلفة ، ومثال على ذلك التخمير حيث يتم استخدام الكائنات المذكورة من أجل صنع أطعمة مثل الزبادي أو الجبن ، أي أن هناك كائنات دقيقة يمكنها تغيير تكوين بعض الأطعمة أو حتى إطالة عمرها الافتراضي.
الكائنات الحية الدقيقة الأكثر تواجدًا في الطبيعة هي البكتيريا ، والتي يمكن العثور عليها في أنواع مختلفة من الموائل ، وهناك بكتيريا يمكن أن تكون ضارة بصحة الإنسان ، ومثال على ذلك " الإشريكية القولونية " ، وهو المسؤول عن أمراض مثل تسمم الدم. على الرغم من ذلك ، هناك بكتيريا أخرى يمكن أن تكون مفيدة للجسم ، ومثال على ذلك "Lactobacillus acidophilus" التي لديها القدرة على إنتاج مواد مختلفة مثل فيتامين K وبيروكسيد الهيدروجين ، والتي يمكن أن تساعد بشكل كبير على الكائن الحي.